2.000/1.900 – 1.700/1.650 π.Χ.

Ο οικισμός του Κουκονησίου διανύει μια ακμάζουσα περίοδο. Κατασκευάζονται νέοι δρόμοι και διαμορφώνονται εκτεταμένες οικοδομικές νησίδες. Κατά το τέλος της περιόδου, ισχυρός σεισμός πλήττει τον οικισμό, προκαλώντας μεγάλες καταστροφές στο χώρο.